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操作規(guī)程
大腸桿菌質(zhì)粒DNA的提取純化方案
質(zhì)粒是獨立于染色體的環(huán)狀DNA分子。在分子生物學(xué)中,他們被用作運送分子,或稱載體,用于承載特定的DNA片段。
利用細菌來復(fù)制質(zhì)粒,可以大規(guī)模生產(chǎn)目的DNA。從細菌中獲得質(zhì)粒的方法稱為質(zhì)粒純化。
質(zhì)粒純化是將質(zhì)粒DNA與基因組DNA、蛋白質(zhì)、核糖體以及細菌細胞壁分離開的一種技術(shù)。
質(zhì)粒純化包括三個基本步驟:細菌的培養(yǎng),細菌的收集和裂解,質(zhì)粒DNA的純化。
實驗材料:含質(zhì)粒的大腸桿菌
試劑、試劑盒:葡萄糖 EDTA Tris-HCl NaOH SDS KAc 異戊醇
儀器、耗材: 臺式高速離心機 、 恒溫振蕩搖床 、高壓滅菌鍋 、振蕩器 、 微量移液器 、 1.5ml離心管 (點擊藍色字體可查看相關(guān)產(chǎn)品)
實驗步驟
純化完成后,有許多方法可用來檢驗質(zhì)粒的純度,以確認質(zhì)粒沒有被基因組DNA污染并且沒有在細菌內(nèi)被修飾。
分光光度計可以通過比較在不同波長條件下的吸光度來測定質(zhì)粒DNA的濃度。(點擊藍色字體可查看相關(guān)產(chǎn)品)
瓊脂糖凝膠電泳也可用來分析質(zhì)粒DNA的大小是否正確或者是否有雜質(zhì)。(點擊藍色字體可查看相關(guān)產(chǎn)品)
應(yīng)用和改動
對于不同的質(zhì)粒大小、拷貝數(shù)、和培養(yǎng)體積,可相應(yīng)改動該質(zhì)粒純化過程,包括使用不同的結(jié)合,清洗和洗脫設(shè)備。其中最主要的區(qū)分標準是質(zhì)粒產(chǎn)量,它將質(zhì)粒制備劃分為微量提取,中量提取,大量提取和超量提取。
關(guān)于下游的應(yīng)用,質(zhì)粒純化后通常會被用于一種叫做轉(zhuǎn)染的技術(shù),它是將質(zhì)粒DNA轉(zhuǎn)入到真核細胞當中。多數(shù)時候,轉(zhuǎn)染的目的是利用報告蛋白來觀察細胞或組織的結(jié)構(gòu)。
有時,分別純化的多個質(zhì)粒會被轉(zhuǎn)入到同一細菌當中,這些質(zhì)粒編碼幾種酶,從而在細菌中再造形成一個完整的生物合成途徑。最終結(jié)果是合成一種復(fù)雜的化合物,例如抗生素。
純化的質(zhì)粒也可能用來重新轉(zhuǎn)化細菌,用于大量生產(chǎn)該質(zhì)粒編碼的蛋白質(zhì)。然后結(jié)晶純化的蛋白來進行結(jié)構(gòu)分析。
參考資料:
《醫(yī)學(xué)生物化學(xué)與分子生物學(xué)實驗技術(shù)雙語教程》和《微生物學(xué)實驗》